Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
DUSP28Q4G0W2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms