Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms