Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms