Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7S5

SMIM21, Small integral membrane protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM21Q3B7S5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM21Q3B7S5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms