Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C18orf21Q32NC0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf21Q32NC0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf21Q32NC0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C18orf21Q32NC0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms