Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms