Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms