Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM16Q2WEN9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms