Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX7Q2KHR2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX7Q2KHR2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms