Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms