Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms