Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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