Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CTF1Q16619 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CTF1Q16619 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CTF1Q16619 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CTF1Q16619 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CTF1Q16619 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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CTF1Q16619 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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CTF1Q16619 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms