Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms