Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS72Q15906 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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