Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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