Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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EFNB3Q15768 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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EFNB3Q15768 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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EFNB3Q15768 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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