Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms