Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RYR3Q15413 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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