Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABEP1Q15276 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms