Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ODF1Q14990 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ODF1Q14990 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ODF1Q14990 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ODF1Q14990 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ODF1Q14990 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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ODF1Q14990 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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