Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPNMBQ14956 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms