Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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CHD4Q14839 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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CHD4Q14839 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD4Q14839 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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