Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS1Q14691 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms