Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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