Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A3Q14050 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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