Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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