Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL3Q13618 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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