Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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