Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms