Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLF1Q13351 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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