Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRSQ13332 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRSQ13332 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRSQ13332 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRSQ13332 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRSQ13332 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRSQ13332 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PTPRSQ13332 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PTPRSQ13332 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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