Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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SGCGQ13326 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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