Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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TRAF3Q13114 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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TRAF3Q13114 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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TRAF3Q13114 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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