Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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CNTN1Q12860 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
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CNTN1Q12860 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
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CNTN1Q12860 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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CNTN1Q12860 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN1Q12860 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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