Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms