Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLEQ07864 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms