Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-1Q07627 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-1Q07627 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms