Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALD1Q05682 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms