Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GBE1Q04446 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms