Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms