Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTBN1Q01082 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms