Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms