Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms