Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTG2P63267 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms