Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms