Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO4P61968 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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