Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMDP57764 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms