Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDDM3BP56851 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms