Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BACE1P56817 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BACE1P56817 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BACE1P56817 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BACE1P56817 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BACE1P56817 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BACE1P56817 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms